O assassino lendário de 39 anos, Juzo Ogami, é picado por uma arma biológica em forma de vespa, e acorda no laboratório do Sindicato de Assassinos Z.O.O. como um garoto do ensino fundamental. Mesmo nessa situação, ele recebe uma missão: se infiltrar numa escola. Juzo vai à contragosto, mas aos poucos ele percebe o quão divertido é estudar. Mas, certo dia, uma figura suspeita invade a escola…!