“…O que o coração significa para você?” “Nosso objetivo é aniquilar toda a humanidade.” Com base nos cálculos do Arquivo, o banco de dados integrado de IA, a humanidade está agora à beira da extinção. Quando a contagem regressiva para a extinção humana começa, Vivy e Matsumoto decidem unir forças com seu arquiinimigo, Toak, a fim de planejar uma estratégia para invadir Arayashiki, o núcleo do Arquivo. No entanto, Matsumoto percebe uma possível solução que apresenta para Vivy, depois que ela é contatada pelo Arquivo.